اهتم عماد الدين زنكي بالجيش اهتماماً كبيراً، وبرز هذا الاهتمام في شكل ووظيفة الدواوين التي كانت تختص بشؤون الجيش والعسكر، وأيضاً في طرق وأساليب عماد الدين زنكي في إدارة المؤسسة العسكرية.
1 ـ الجيش: كانت مؤسسة الجيش الضاربة قد استخدمها زنكي للقضاء على الإمارات المحلية لكي يوحدها في جبهة إسلامية متماسكة ليستطيع مجابهة الصليبيين، وقد اعتنى بجيشه بحيث أصبح قوياً متماسكاً. ومن الأمور المتعلقة بالجيش التي اهتم بها زنكي:
أ ـ ديوان الجيش: نظم زنكي ديوان الجيش؛ ليقوم بالإشراف على أمور الجند وتنظيمهم، وتوزيع رواتبهم، وأعطياتهم بانتظام، وجعل على رأس هذا الديوان موظفاً أعلى يطلق عليه «أمير حاجب»، وكان عمله أن ينصف بين الأمراء والجند، تارة بنفسه، وتارة بمشاورة السلطان، وتارة بمراجعة النائب، وإليه تقديم من يعرض ومن يرد وعرض الجند، وما ناسب ذلك. (صبح الأعشى، أحمد القلقشندي، (4/‏19).
كما كان ينظر في مخاصمة الأجناد واختلافهم في أمور الإقطاعات ونحو ذلك.
وكان للجواسيس أهمية كبيرة في المعارك التي خاضها زنكي، وكانوا ينتشرون في مناطق العدو، ويطلعون أميرهم على تحركاته، وإمكانياته لكي يكون على بينة من الأمر، وكان زنكي يحدد موقفه الحربي أحياناً بناء على ما يقدمه هؤلاء من معلومات، ومن ثم يتجه هو أو أحد قواده على رأس الجيش لفرض الحصار، فإذا ما استدعت الظروف السرعة في السير؛ اتخذ من الوسائل ما يكفل ذلك، ففي عام 528هـ على سبيل المثال توجه إلى (خلاط) وأراد الوصول إليها بسرعة، فسلك طريقاً عبر الجبال عبر الطريق المسلوك، وكان جنده يستريحون، كل واحد في موضعه دون خيام. وعندما توجه لحصار الرُّها عام 539هـ استعان على السرعة بركوب النجائب (أي: الإبل صغيرة العمر). (عماد الدين زنكي، عماد الدين خليل، ص 202).
ص ـ الاستخبارات: أقام عماد الدين زنكي جهازاً للمخابرات، وخصص له الموظفين، والرواتب، وقد ورد عنه أنَّه: كان شديد العناية بأخبار الأطراف وما يجري لأصحابها حتى في خلواتهم، وكان له في بلاد السلطان السلجوقي من يطالعه، ويكتب إليه بكل ما يفعله السلطان في ليله ونهاره، وحرب وسلم، وهزل وجد، وكان يصرف على ذلك الأموال الجليلة، وكان يصل إليه في كل يوم عدة قاصدين، أو كتب كما كان له في كل بلد من يطالعه بالأخبار. 
وقد اتصف عماد الدين زنكي بالدراية الواسعة والحذر في هذا المجال، فكان لا يُمكِّن رسول ملك يعبر في بلاده بغير إذنه، وإذا استأذنه رسول في العبور إلى بلاده أذن له، وأرسل إليه من يسيره، ولا يتركه يجتمع بأحد من الرعية ولا غيرهم، فكان الرسول يدخل بلاده ويخرج منها، ولا يعلم من أحوالها شيئاً البتة، كما كان لا يمكِّن أحد موظفيه من مغادرة بلاده، ويعلل ذلك بأن البلاد كبستان عليه سياج فمن هو خارج السياج يهاب الدخول، فإذا خرج منها من يدل على عورتها ويطمع العدو فيها؛ زالت الهيبة، وتطرق الخصوم إليها وهنالك عدد من الروايات حول هروب بعض موظفيه، وفلاحيه إلى الإمارات الأخرى، وإلحاحه بإعادتهم إلى إمارته؛ حتى لو اضطره ذلك إلى استخدام القوة. (كتاب الروضتين، أبي شامة المقدسي، ج2 ص283)
وقد قدم جهاز مخابراته خدمات مهمة له في ظروف شتَّى، ولعب دوراً هاماً في حصار بعرين عام 531هـ، وحصار الرُّها عام 539هـ، كما كان يستخدمه عماد الدين للتعرف على أحوال الجند لدى حصارهم بعض المواقع وملاحظة ما يصل إليهم من رواتب وسلاح، وكان عماد الدين زنكي مع اشتغاله بأمور الدولة الهامة لا يهمل الاطلاع على القضايا الثانوية، معللاً ذلك بأن الصغير إذا لم يعرف؛ ليمنع؛ صار كبيراً. وكان من الطبيعي أن رجال المخابرات في الدولة الزنكية ارتبطوا بعماد الدين مباشرة نظراً لأهمية دورهم السياسي والعسكري. (التاريخ الباهر، ابن الأثير، مرجع سابق، ص78)
و كان عماد الدين زنكي ذا هدف واضح، وهذا أول شروط النجاح، وكان جاداً ومثابراً في تنفيذ خططه، وكان غالباً لا يهادن الصليبيين قاسياً عليهم.